NEB內(nèi)切酶可提供210多種內(nèi)切酶，其中有130多種內(nèi)切酶為重組酶。重組技術(shù)的運用，使NEB能在提高內(nèi)切酶的純度及品質(zhì)的同時，削減生產(chǎn)費用。
加入酶之前將反應(yīng)混合物混勻，可以用移液槍上下吹打或輕彈管壁，然后在離心機中快速離心。切忌振蕩混勻。
一般情況下，我們推薦使用5-10單位酶量/μgDNA，基因組DNA用10-20單位酶量消化1小時。入內(nèi)切酶的量應(yīng)不超過總體積的10%，以避免甘油過量引起的星號活性。貯存液中的添加物和底物溶液中尚存的殘余物（會導(dǎo)致小體積反應(yīng)出現(xiàn)問題。如果在切割底物DNA時遇到了問題，建議加入以下對照實驗：
1、酶切對照DNA（含有多個已知內(nèi)切酶切割位點的DNA，如LambdaDNA或腺病毒-2DNA），以檢測內(nèi)切酶的活性。
2、如果對照DNA能夠被切割而實驗中的底物DNA不能，可以將這兩種DNA混合在一起再進行酶切，以檢測實驗用的底物DNA中是否存在抑制反應(yīng)的物質(zhì)。如果確實存在某種抑制因子（通常為鹽、EDTA或酚），則混合之后對照DNA也不能被切割。
3、當(dāng)內(nèi)切酶在非zui適條件下使用時可能會產(chǎn)生星號活性。
4、可以通過以下方法降低星號活性：使用高保真（HF）內(nèi)切酶、縮短溫育時間、使用省時內(nèi)切酶或者增大反應(yīng)體積。
